うーん、なんで今ごろこんなことに気付いた？
ownCloudで管理する場所で作業していたのだけど、bitbucketにcommitしようとしても
fatal: not a git repository (or any of the parent directories): .gitと言われてしまう。よく見ると .git ディレクトリがないじゃないの。ownCloudの設定を見たらデフォルトで隠しファイルが同期されないようになってた。しょうがなく今のファイルを退避し、再度cloneしてきてところに退避したのを戻してcommitしました。そして .gitをtouch。